GRIB. Research Unit on Biomedical Informatics





News & activities

LOD cloud

DisGeNET inclòs en el diagrama Linking Open Data (LOD)

La plataforma per a l’anàlisi de les malalties humanes i els seus gens DisGeNET, desenvolupada pel Grup de recerca en Informàtica Biomèdica Integrativa del GRIB (IMIM-UPF) dirigit per Laura I. Furlong i Ferran Sanz, apareix per primera vegada en el diagrama de vinculació Linking Open Data (LOD).

Aquest tipus de diagrama mostra conjunts de dades en format Linked Data, que utilitza la World Wide Web (Web) per connectar dades estructurades i relacionades. El Linked Data és la millor manera d’exposar, compartir i connectar dades, informació i coneixement a la Web Semàntica.

La presència de DisGeNET en aquest diagrama és important perquè posa de manifest que la base de dades DisGeNET es publica d'acord amb els principis del Linked Data, i fa que sigui més visible i detectable pels usuaris del diagrama.

More info...

B·Debate simposi: Big Data in Biomedicine. Challenges and Opportunities

Prop de 200 bioinformàtics nacionals i internacionals han debatut al llarg de dos dies a CaixaForum Barcelona, els reptes i les oportunitats de les dades massives (big data) en biomedicina, convocats per B•Debate, la iniciativa de Biocat i l’Obra Social “la Caixa” per a promoure el debat científic.

Aquest esdeveniment, organitzat conjuntament per Bioinformatics Barcelona (BIB), l’European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), el GRIB (IMIM-UPF) i B·DEBATE, ha tingut com objectiu proporcionar un fòrum interdisciplinari adreçat a informàtics, bioinformàtics, així com  científics i professionals de la biomedicina.

More info...

More news RSS

Last project

eTOX

Integrating bioinformatics and chemoinformatics approaches for the development of expert systems allowing the in silico prediction of toxicities. European project funded by IMI, extended until 2016 and coordinated by the GRIB. The eTOX project aims to develop a drug safety database from the pharmaceutical industry legacy toxicology reports and public toxicology data, innovative in silico strategies and novel software tools to better predict the toxicological profiles of small molecules in early stages of the drug development pipeline.

http://www.e-tox.net/index.html

More projects

Last publications

  • Antolin A, Mestres J*. Distant Polypharmacology among MLP Chemical Probes. ACS Chem Biol 2014. PMID: 25365788 .
  • Guiu J, Bergen D, De Pater E, Islam A, Ayllón V, Gama-Norton L, Ruiz-Herguido C, González J, López-Bigas N, Menéndez P, Dzierzak E, Espinosa L, Bigas A*. Identification of Cdca7 as a novel Notch transcriptional target involved in hematopoietic stem cell emergence. J Exp Med, 2014 . PMID: 25385755 .
  • Cases M, Briggs K, Steger-Hartmann T, Pognan F, Marc P, Kleinöder T, Schwab CH, Pastor M, Wichard J, Sanz F. The eTOX Data-Sharing Project to Advance in Silico Drug-Induced Toxicity Prediction. Int J Mol Sci, 2014; 15(11):21136-21154 DOI: 10.3390/ijms151121136.
  • Stanley N, Esteban S*, de Fabritiis G*. Kinetic modulation of a disordered protein domain by phosphorylation. Nat Commun, 2014; 5: 5272 . PMID: 25348080 .

More publications



Site Information

Warning: Unknown: 1 result set(s) not freed. Use mysql_free_result to free result sets which were requested using mysql_query() in Unknown on line 0