GRIB. Research Unit on Biomedical Informatics





News & activities

Chemotargets llença al mercat CTlink[GUI], interfície gràfica del ‘software’ CTlink

La spin off del GRIB (IMIM-UPF) Chemotargets, ha tret al mercat el CTlink[GUI], versió comercial amb interfície gràfica del software CTlink que pretén oferir eines gràfiques intuïtives i interactives per analitzar els resultats del 'software'

El CTlink és un software independent de plataforma que permet predir com una small mollecula interactua amb determinades proteïnes. Aquesta plataforma necessita un quimioinformàtic per fer-la servir i ser instal·lada en un servidor. En canvi, amb l’arribada d’aquesta versió més comercial, Chemotargets obre el seu mercat i qualsevol químic, farmacòleg o toxicòleg, pot dibuixar l’estructura de la molècula, tirar el càlcul i li retornen els resultats. ‘Només cal posar el codi de la molècula  o el dibuix de l’estructura, ho entres al servidor i et retorna no només el que se sap de les proteïnes que interaccionen, sinó que també una predicció’, afirma Jordi Mestres, CEO de Chemotargets.

More info...

Thesis defence of Nathaniel Stanley: "Understanding disordered and membrane protein recognition by molecular dynamics"

On 24th of April at 11:00, Nathaniel Stanley, member of the Computational Biophysics group of GRIB (IMIM-UPF) will defend his thesis at Josep Marull Room (QMAR building). You are all invited to this event.

More info...

More news RSS

Last project

iPIE

The project iPIE: "Intelligence Led Assessment of Pharmaceuticals in the Environment", aims to develop a predictive framework that utilise existing information and in silico models to support more intelligent environmental testing of pharmaceuticals in development and to prioritise legacy pharmaceuticals for full environmental risk assessment and/or environmental (bio) monitoring. European project funded by IMI for the period 2015-2017.

More projects

Last publications

  • Smedley D, Haider S, Durinck S, Pandini L, Provero P, Allen J, Arnaiz O, Awedh MH, Baldock R, Barbiera G, Bardou P, Beck T, Blake A, Bonierbale M, Brookes AJ, Bucci G, Buetti I, Burge S, Cabau C, Carlson JW, Chelala C, Chrysostomou C, Cittaro D, Collin O, Cordova R, Cutts RJ, Dassi E, Genova AD, Djari A, Esposito A, Estrella H, Eyras E, Fernandez-Banet J, Forbes S, Free RC, Fujisawa T, Gadaleta E, Garcia-Manteiga JM, Goodstein D, Gray K, Guerra-Assunção JA, Haggarty B, Han DJ, Han BW, Harris T, Harshbarger J, Hastings RK, Hayes RD, Hoede C, Hu S, Hu ZL, Hutchins L, Kan Z, Kawaji H, Keliet A, Kerhornou A, Kim S, Kinsella R, Klopp C, Kong L, Lawson D, Lazarevic D, Lee JH, Letellier T, Li CY, Lio P, Liu CJ, Luo J, Maass A, Mariette J, Maurel T, Merella S, Mohamed AM, Moreews F, Nabihoudine I, Ndegwa N, Noirot C, Perez-Llamas C, Primig M, Quattrone A, Quesneville H, Rambaldi D, Reecy J, Riba M, Rosanoff S, Saddiq AA, Salas E, Sallou O, Shepherd R, Simon R, Sperling L, Spooner W, Staines DM, Steinbach D, Stone K, Stupka E, Teague JW, Dayem Ullah AZ, Wang J, Ware D, Wong-Erasmus M, Youens-Clark K, Zadissa A, Zhang SJ, Kasprzyk A. The BioMart community portal: an innovative alternative to large, centralized data repositories. Nucleic Acids Res, 2015. PMID: 25897122 .
  • Piñero J, Queralt-Rosinach N, Bravo À, Deu-Pons J, Bauer-Mehren A, Baron M, Sanz F, Furlong LI. DisGeNET: a discovery platform for the dynamical exploration of human diseases and their genes. Database (Oxford), 2015. PMID: 25877637 . DOI: 10.1093/database/bav028.
  • Berenstein AJ, Piñero J, Furlong LI, Chernomoretz A. Mining the Modular Structure of Protein Interaction Networks. PLoS ONE, 2015; 10(4): e0122477. PMID: 25856434 . DOI: 10.1371/journal.pone.0122477.
  • Martinez-Aranda A, Hernandez V, Guney E, Muixi L, Foj R, Baixeras N, Cuadras D, Moreno V, Urruticoechea A, Gil M, Oliva B, Moreno F, Vidal N, Andreu X, Segui MA, Ballester R, Castella E, Sierra A. FN14 expression in breast cancer is a prognostic and predictive biomarker of brain metastasis outcome that can be targeted with immunomodulators. CLIN EXP METASTAS, 2015; 32 (3):238-239

More publications



Site Information

Warning: Unknown: 1 result set(s) not freed. Use mysql_free_result to free result sets which were requested using mysql_query() in Unknown on line 0